某一日，布鲁斯·班纳研发的环太平洋海洋监控系统监测到了新的蓝血怪兽出现，这只怪兽自太平洋深处现身，一路向东，直奔美洲的西海岸城市洛杉矶而来。
胜利队收到警报，正要出击，监控系统却报告了另一头怪兽出现的消息,这只怪兽袭击的方向正好和第一只相反，一路向西，直奔港岛而去。
两只怪兽同时出现并分袭两处，是以前从没有出现过的情况，科尔森不得不兵分两路，让唐和娜塔莎前去救援港岛,胜利队剩余人马守卫洛杉矶。
由于重要战力缺失,科尔森同意了托尼·斯塔克加入，由他设计制造的新一代超级机甲“复仇者”正式登场,由美国队长史蒂夫·罗杰斯亲自驾驶，在海中和意图登陆洛杉矶的怪兽“公牛”展开了激烈的战斗，并最终战而胜之，取得了超级机甲对怪兽的完全胜利。
斯塔克的猎人计划，从计划开始就保守内外质疑，期间经历了无数的困难和挫折，到今天终于开花结果，成为了人类对抗怪兽的又一个强力手段。
另一方面，唐变身迪迦奥特曼，轻而易举的消灭了另一头怪兽，快到胜利队总部甚至没来得及给它起一个响亮的代号。
迪迦消灭怪兽之后，追踪源头，发现了位于太平洋深处马里亚纳海沟里的虫洞通道，因为深海环境过于恶劣，迪迦的能量消耗太大，尝试使用光线攻击无果之后，不得不放弃攻击，先行撤退。
蓝血怪兽的力量越来越强,数量也越来越多，这次甚至展现出了战术配合，这一切引起了胜利队的高度警觉，在民间也掀起了不小的风浪，有鉴于此，胜利队决定发起一次深海远征，意图彻底摧毁虫洞，解决蓝血怪兽的问题。
因为虫洞在深达万米的马里亚纳海沟海底，那里低温高压，极度黑暗的环境使迪迦的实力受到了极大的削弱，经过讨论，决定由刚刚立下殊功的猎人机甲承担主力作战任务。
斯塔克获得了环太平洋联合防御委员会的拨款支持，并在神盾局的帮助下，争分夺秒的开始了新机甲的建造和旧机甲的改造工程，使它们都具备深海作战的能力。
然而机甲易造，像史蒂夫这样合格的机甲驾驶员却难找，不是随便什么超级士兵就能充任的。
唐对开高达很有兴致盎然,主动报名参加驾驶员训练，结果很不美妙，一记主炮差点儿报销了整个基地，至此，唐的跨界梦碎，支线任务——无敌高达挑战失败，只能继续主线剧情——光的传说。
经过严格的考察，最后只有胜利队新招收的队员，黑豹特查满足要求入选，立即开始了驾驶员训练。
斯塔克一共建造了三台猎人机甲，计划全部投入战斗，然而合格的机甲驾驶员只有两名，正当众人为此头疼的时候，由赵海伦提出了“双人操作，联合驾驶”的新想法，得到了斯塔克和布鲁斯·班纳的支持。
新想法需要神经学方面的顶级专家帮助实现，娜塔莎请了一直赋闲在家的梅丽娜出山，一番周折，最终完成了机甲的双人联合驾驶系统。
双人联合驾驶，对两名驾驶员之间的默契程度要求很高，急切之间，只有娜塔莎和叶莲娜这对没有血缘关系的亲姐妹能够勉强要求，她们两个小一块长大，接受相同的训练，后来虽然分别了许久，相互之间的配合默契却是别人拍马都赶不上的。娜塔莎纵然一千个不愿意，也不得不接受叶莲娜很快要和她踏上战场的事实。
神经元桥接技术的应用，使驾驶员共享情感记忆，彼此再无秘密可言，两姐妹在训练的过程中，慢慢的敞开心胸，相互理解，明白了彼此对对方的关心和爱护，终于消弭了芥蒂，完成了训练课程，成为了合格的机甲驾驶员。
简·福斯特从阿斯加德归来，带回了至关重要的宇宙魔方，同时还带回来了洛基越狱，准备对地球不利的消息。
这时候前方发现海底的空间虫洞有再度扩大的征兆，很有可能马上会有更加强大的蓝血怪兽袭击地球，众人不得不先把洛基的事情放下，决定立刻发起深海远征，抢先一步彻底摧毁虫洞。
简和班纳借助魔方的力量，设计出了一款能够虫洞的空间武器，搭载在了‘复仇者’机甲上。
神盾局启动了超大型海上移动基地“木筏”，携带着三台猎人机甲还有胜利队的全部作战力量浩浩荡荡的使进了太平洋深处。
史蒂夫驾驶着“复仇者”机甲，在特查拉的“瓦坎达万岁”和娜塔莎姐妹的“喀秋莎”两家机甲掩护下，往海底虫洞杀去。
敌人发现了机甲靠近，派出了三头更加强大的蓝血怪兽——棱背龟，尾立鼠和毒妇拦截，经过激烈的战斗，怪兽终于被一一消灭，然而三台机甲也受损严重，“复仇者”的空间武器也在战斗中损毁。
正当史蒂夫等人考虑撤退的时候，第四头怪兽终于姗姗来迟，它比前面的三头体型更大，实力更强，因此钻出虫洞花费的时间也更长。
只一个照面，“瓦坎达万岁”就被开肠破肚，撕成碎片，特查拉乘坐紧急救生舱套退，“复仇者”和“喀秋莎”合力，也只能勉强自保，想要脱身却万万不能，随着时间的推移，两架机甲渐渐不支，机毁人亡随时都有可能发生。
关键时刻，唐变身为迪迦奥特曼前去救援，不出意外的，因为环境恶劣，一上来就陷入了能量不足的窘境，然而迪迦还是勉强支撑住了战局，掩护着两架机甲顺利撤退。
海底，迪迦和终极蓝血怪兽“缝合怪”一场大战，对它造成了严重的伤害，因为能量不足，便打算先行撤退，结果被“缝合怪”的触手缠住，困在了海底，脱身不得。
眼见迪迦就要长眠海底，鹰眼巴顿和猎鹰山姆·威尔逊驾驶着海豚号潜艇赶来，将宇宙魔方发射到了迪迦的手上。迪迦捏碎魔方，完全吸收了空间宝石的力量，最终打败了“缝合怪”，摧毁了虫洞。
敌人意图改造地球，消灭人类的阴谋破产了，这次胜利，不是迪迦一个人的功劳，也不只是胜利队一只队伍的功劳，它离不开所有人的齐心协力。
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